Aquí hay un desglose de las diferencias clave:
Prokaryotes:
* Estructura del promotor simple: Los promotores procariotas son típicamente cortos y contienen dos secuencias conservadas, la caja -10 (caja de pribnow) y el cuadro -35, que son reconocidos por el factor sigma de la ARN polimerasa.
* proximidad al sitio de inicio de la transcripción: Estas cajas se encuentran relativamente cerca del sitio de inicio de la transcripción (alrededor de las bases -10 y -35 aguas arriba), lo que permite un proceso de inicio simple y eficiente.
* Interacción directa con ARN polimerasa: La ARN polimerasa se une directamente a la región promotora, facilitada por el factor Sigma que reconoce las cajas -10 y -35. Esta interacción directa permite que la transcripción comience rápidamente.
eucariotas:
* Estructura promotora más compleja: Los promotores eucariotas son más complejos y contienen una variedad más amplia de elementos, incluido el promotor central (que contiene la caja Tata, el elemento iniciador y el elemento promotor aguas abajo) y los elementos regulatorios aguas arriba (como potenciadores y silenciadores).
* Más distancia desde el sitio de inicio de la transcripción: Los promotores eucariotas se pueden ubicar mucho más lejos del sitio de inicio de la transcripción, a veces incluso miles de bases aguas arriba.
* Interacción indirecta con ARN polimerasa: En lugar de unirse directamente al promotor, la ARN polimerasa II en eucariotas requiere el ensamblaje de un complejo de factores de transcripción (factores de transcripción generales) para iniciar la transcripción. Estos factores se unen a los elementos promotores del núcleo y reclutan la ARN polimerasa II.
Por qué existen estas diferencias:
* Complejidad de la regulación génica: Los eucariotas tienen un sistema mucho más complejo de regulación génica, que implica una gama más amplia de factores y mecanismos reguladores. La estructura promotora compleja y la participación de los factores de transcripción permiten un mayor grado de control sobre la expresión génica.
* Compartimización nuclear: En los eucariotas, la transcripción ocurre dentro del núcleo, separada de la traducción en el citoplasma. Esta compartimentación requiere mecanismos más elaborados para regular la expresión génica, lo que se refleja en la complejidad de los promotores eucariotas.
* Estructura de cromatina: El ADN eucariota se empaqueta en cromatina, una estructura compleja de ADN y proteínas. Este embalaje presenta una barrera para la transcripción y requiere mecanismos adicionales para acceder al ADN. Esto se aborda en parte por la compleja estructura promotora y la participación de factores de transcripción.
En esencia, las diferencias en la estructura y el posicionamiento del promotor reflejan los desafíos organizacionales y regulatorios muy diferentes que enfrentan los procariotas y los eucariotas. Los promotores eucariotas se adaptan para manejar las complejidades de su organización celular y regulación génica, mientras que los promotores procariotas priorizan la eficiencia y la interacción directa con la maquinaria de transcripción.
