Cuando los estomas están abiertos, el aire puede entrar en la hoja y difundirse hacia los espacios intercelulares del mesófilo esponjoso. Estos espacios aéreos están conectados a los vasos del xilema y floema que transportan agua y nutrientes por toda la hoja. Los espacios aéreos también proporcionan una vía para la difusión de dióxido de carbono y oxígeno, que son esenciales para la fotosíntesis y la respiración, respectivamente.
La apertura y cierre de los estomas está controlada por células protectoras, que son células especializadas que rodean el estoma. Cuando las células de guarda están turgentes, el estoma está abierto y cuando las células de guarda están flácidas, el estoma está cerrado. La turgencia de las células protectoras está regulada por varios factores, incluida la concentración de dióxido de carbono en la atmósfera, la intensidad de la luz y el estado hídrico de la hoja.