* mitocondrias: Estos orgánulos, a menudo llamados "potencias de la célula", tienen su propio ADN, llamado ADN mitocondrial (ADNmt). El ADNmt es circular y codifica algunas de las proteínas involucradas en la respiración celular.
* cloroplastos (en plantas): Similar a las mitocondrias, los cloroplastos, que son responsables de la fotosíntesis, también contienen su propio ADN llamado ADN de cloroplasto (ADNm).
* Otros compartimentos celulares: Si bien es menos común, las cantidades trazas de ADN a veces se pueden encontrar en otros compartimentos celulares como el citoplasma, aunque este suele ser el resultado del daño celular o procesos celulares específicos.
Es importante tener en cuenta que estas moléculas de ADN extranuclear (ADNmt y CPDNA) son distintas del ADN nuclear y tienen sus propias características y funciones únicas.