1. Flexión del ADN: Las proteínas pueden inducir curvaturas en la doble hélice del ADN, lo que puede exponer secuencias ocultas de ADN. Esto se puede lograr mediante proteínas que se unen a secuencias de ADN específicas e inducen un cambio conformacional en la estructura del ADN, o mediante proteínas que se unen a la columna vertebral del ADN e inducen una curvatura en el ADN sin especificidad de secuencia.
2. Bucle de ADN: Las proteínas pueden acercar secuencias de ADN distantes formando un bucle con el ADN. Esto se puede lograr mediante proteínas que se unen a dos secuencias de ADN diferentes y las unen, o mediante proteínas que se unen a una única secuencia de ADN e inducen un bucle en el ADN.
3. Fusión del ADN: Las proteínas pueden derretir la doble hélice del ADN, lo que puede exponer secuencias de ADN ocultas. Esto se puede lograr mediante proteínas que se unen a secuencias de ADN específicas y rompen los enlaces de hidrógeno entre los pares de bases del ADN, o mediante proteínas que se unen a la columna vertebral del ADN e inducen un cambio conformacional en la estructura del ADN que conduce a la fusión.
4. Desenrollado del ADN: Las proteínas pueden desenrollar la doble hélice del ADN, lo que puede exponer secuencias de ADN ocultas. Esto se puede lograr mediante proteínas que se unen a secuencias de ADN específicas y desenrollan el ADN de una manera específica de secuencia, o mediante proteínas que se unen a la columna vertebral del ADN e inducen un cambio conformacional en la estructura del ADN que conduce al desenrollamiento.
5. Otros mecanismos: Además de estos mecanismos, las proteínas también pueden unirse a secuencias ocultas de ADN mediante otros mecanismos, como intercalando entre pares de bases de ADN, uniéndose a modificaciones del ADN o interactuando con otras proteínas que están unidas al ADN.
El mecanismo específico por el cual una proteína se une al ADN oculto depende de la estructura y función de la proteína, así como de la secuencia y estructura del ADN.
