El llamado a la comunidad científica, publicado en la revista Nature , se basa en la experiencia adquirida al coordinar el repositorio de metadatos de AviSample Network, que actualmente contiene metadatos de más de 35.000 muestras de casi 500 especies de aves.

La comunidad científica ha estado optimizando sistemáticamente las actividades de investigación y hay una serie de iniciativas que persiguen activamente este objetivo. El proyecto liderado por Brlík va aún más lejos:"Nuestra iniciativa demuestra que la disponibilidad y la trazabilidad de la información básica sobre las muestras (los llamados metadatos) tiene el potencial de hacer que la investigación científica sea más eficiente, ahorrar recursos financieros y humanos y diversificar los equipos de investigación. a nivel global."

Y añade:"Esta iniciativa no se ocupa del almacenamiento de muestras físicas o de datos. Sólo estamos interesados ​​en información básica sobre muestras biológicas, en pocas palabras, cuándo, dónde y cómo se recolectaron las muestras y cómo se conservan. Estos metadatos son económicos, aplicables a nivel global y facilitan el uso de muestras ya recolectadas, lo que beneficia tanto a los propietarios de las muestras como a los investigadores que las utilizarán."

El principio de compartir metadatos de muestra y reutilizar muestras existentes es beneficioso en muchos sentidos. Los informes centralizados y estandarizados de los metadatos de las muestras facilitan ver qué muestras están disponibles actualmente sin exigir comunicación con colegas ni una costosa recopilación de nuevas muestras.

Por lo tanto, compartir metadatos podría agilizar las actividades científicas, especialmente en áreas menos exploradas y de difícil acceso, y al mismo tiempo fortalecer colaboraciones clave con científicos locales. De manera similar, informar metadatos de muestra ayudaría a los científicos cuyas investigaciones se centran en especies en peligro de extinción o en grandes escalas espaciales.

"La idea inicial de esta iniciativa surgió durante mis estudios de doctorado, cuando buscaba muestras de plumas procedentes de una gran zona del África subsahariana. Tenía muestras de nuestro grupo de investigación, pero necesitaba ampliar el conjunto de datos. considerablemente.

"Escribimos a colegas de Suecia y Suiza de quienes sospechábamos que tenían muestras similares de otros lugares de África. Y afortunadamente resultó que efectivamente las tenían. Aunque recogieron las muestras principalmente para un propósito completamente diferente, logramos A través de este esfuerzo conjunto se cubrirá una gran parte de la región del África subsahariana, lo que no habría sido posible sin la cooperación con colegas", dice Brlík, describiendo los orígenes del proyecto actual.

En 2022, Brlík y un equipo de colegas (en particular Pavel Pipek del Departamento de Ecología de la Facultad de Ciencias de la Universidad Charles y Petr Procházka del Instituto de Biología de Vertebrados de la CAS) crearon el repositorio de metadatos de la Red AviSample. En esta base de datos, los ornitólogos ahora pueden introducir metadatos de muestras de aves, es decir, dónde, cuándo y cómo se recolectó la muestra, de qué especies de aves y cómo se almacenan estas muestras.

La base de datos incluye actualmente información sobre casi 500 especies de aves y hay metadatos disponibles para más de 35.000 muestras. El repositorio cuenta con varios embajadores que participan en la difusión de la iniciativa en sus regiones.

"Uno de los ejemplos de reutilización de muestras existentes gracias al intercambio de metadatos es el proyecto B10K. Este proyecto tiene como objetivo estudiar los genomas de las 10.000 especies de aves, que los coordinadores del proyecto están recopilando principalmente en museos.

"Sin embargo, para las especies raras y las especies que se encuentran en áreas poco estudiadas (por ejemplo, los trópicos) no es fácil obtener muestras. Compartir metadatos de muestras almacenadas en las colecciones de los investigadores ha hecho posible utilizar muestras existentes recolectadas en África y Europa, para esta gran proyecto a gran escala", describe Brlík.

En una correspondencia publicada en su artículo, Brlík muestra, utilizando la red AviSample como ejemplo, que compartir metadatos facilita la reutilización de muestras existentes almacenadas en las colecciones de los investigadores y, por lo tanto, tiene un enorme potencial.

"Mi objetivo es llevar esta iniciativa y este cambio de percepción a un nivel global y mostrar que compartir metadatos de muestras tiene el potencial de mejorar la eficiencia de las actividades científicas en todas las disciplinas biológicas", concluye Brlík.

Más información: Vojtěch Brlík, Los metadatos estandarizados para muestras biológicas podrían desbloquear el potencial de las colecciones, Naturaleza (2024). DOI:10.1038/d41586-024-01421-w

Información de la revista: Naturaleza

Proporcionado por la Universidad Carolina