Sin embargo, algunos procesos de fermentación especializados puede ocurrir en otros compartimentos celulares:
* mitocondrias: Si bien no está directamente involucrado en la fermentación, las mitocondrias pueden desempeñar un papel en ciertas vías de fermentación proporcionando sustratos o eliminando subproductos. Por ejemplo, en la fermentación del ácido láctico, el piruvato producido en la glucólisis se transporta a las mitocondrias, donde se puede procesar más.
* Vacuolas: En algunos organismos, las vacuolas pueden actuar como compartimentos de almacenamiento para productos de fermentación. Por ejemplo, en levadura, la vacuola puede almacenar etanol producido durante la fermentación alcohólica.
Es importante recordar que estas son excepciones, y la gran mayoría de los procesos de fermentación ocurren en el citoplasma.