Sin embargo, es importante tener en cuenta que la clasificación de la vida en cinco reinos (Monera, Protista, Fungi, Plantae y Animalia) es un sistema más antiguo. Los sistemas de clasificación modernos, como el sistema de tres dominios, lo han reemplazado en gran medida.
En el sistema de tres dominios, los procariotas se dividen en dos dominios:
* bacterias
* Archaea
Si bien ambos son procariotas, tienen diferencias significativas en su genética, bioquímica e historia evolutiva.
