* Membrana externa: Esta membrana es suave y permeable a las moléculas pequeñas.
* Membrana interna: Esta membrana está altamente plegada en Cristae, lo que aumenta su área de superficie. Es menos permeable y contiene muchas proteínas involucradas en el transporte de electrones y la producción de ATP.
El espacio entre estas dos membranas se llama espacio de intermembrana , mientras que el espacio encerrado por la membrana interna se llama la matriz .