El detergente líquido utilizado en la extracción de ADN genómico suele ser un detergente suave no iónico como el dodecilsulfato de sodio (SDS) o Triton X-100. En el contexto de la extracción de ADN genómico, la función principal del detergente líquido es lisar las células y liberar el contenido celular, incluido el ADN genómico, en el tampón de extracción. Aquí hay una explicación detallada de su papel en el proceso de extracción:

1. Lisis celular:Los detergentes líquidos son moléculas anfipáticas, lo que significa que tienen regiones tanto hidrófilas (que aman el agua) como hidrófobas (que odian el agua). Las regiones hidrófobas de las moléculas de detergente interactúan y alteran la bicapa lipídica de la membrana celular, provocando que se disuelva y se rompa. Esto conduce a la lisis o ruptura de las células y la liberación de su contenido intracelular al tampón de extracción circundante.

2. Solubilización de componentes celulares:después de la lisis celular, los componentes intracelulares, incluidas proteínas, lípidos y ácidos nucleicos, se liberan en el tampón de extracción. Sin embargo, estos componentes pueden permanecer asociados entre sí, formando complejos o agregados que pueden dificultar la extracción eficiente de ADN. El detergente líquido ayuda a solubilizar estos complejos al interrumpir las interacciones entre diferentes moléculas y promover su dispersión en todo el tampón. Este paso de solubilización es crucial para garantizar la liberación eficiente y la accesibilidad del ADN genómico.

3. Desnaturalización de proteínas:además de lisar células y solubilizar componentes celulares, el detergente líquido también contribuye a la desnaturalización de proteínas durante la extracción de ADN. Las proteínas pueden unirse e interactuar con el ADN, interfiriendo potencialmente con su aislamiento. El detergente interrumpe estas interacciones proteína-ADN y despliega las estructuras de las proteínas, asegurando que el ADN genómico permanezca libre en solución y accesible para pasos de purificación posteriores.

4. Inhibición de las desoxirribonucleasas (DNasas):algunos detergentes líquidos, como el SDS, poseen la propiedad adicional de inhibir la actividad de las desoxirribonucleasas (DNasas), que son enzimas que pueden degradar el ADN. Este efecto inhibidor ayuda a preservar la integridad del ADN genómico extraído evitando su degradación durante el proceso de extracción.

Vale la pena señalar que el detergente líquido específico utilizado en la extracción de ADN genómico puede variar según el método de extracción y las preferencias de cada investigador. Si bien comúnmente se emplean SDS y Triton X-100, también se pueden usar otros detergentes suaves con propiedades similares para este propósito.