2. Ciclo de Krebs (ciclo del ácido cítrico): Esto ocurre en la matriz de las mitocondrias e implica una serie de nueve reacciones químicas. Durante el ciclo de Krebs, las moléculas de piruvato de la glucólisis se descomponen en dióxido de carbono y ATP. Este proceso también da como resultado la generación de NADH, FADH2 y GTP.
3. Fosforilación oxidativa: Esto ocurre en la membrana interna de las mitocondrias e involucra una serie de cuatro complejos. Durante la fosforilación oxidativa, las moléculas NADH y FADH2 de la glucólisis y el ciclo de Krebs se utilizan para generar ATP. Este proceso también da como resultado la producción de agua.