Resumen:
La actual pandemia de COVID-19 causada por el virus SARS-CoV-2 ha creado una necesidad urgente de intervenciones terapéuticas eficaces. La pradimicina A, un producto natural aislado de Streptomyces, ha demostrado una actividad antiviral prometedora contra varios virus con envoltura, incluido el SARS-CoV-2, al atacar el N-glicano viral. Sin embargo, los detalles moleculares de cómo la pradimicina A interactúa con el N-glicano e inhibe la entrada viral aún no están claros. Realizamos acoplamiento molecular, simulaciones de dinámica molecular y experimentos de resonancia de plasmón superficial (SPR) para investigar la base molecular de la unión de pradimicina A al N-glicano del SARS-CoV-2. Nuestros resultados sugieren que la pradimicina A forma complejos estables con el N-glicano a través de enlaces de hidrógeno, interacciones electrostáticas y contactos hidrofóbicos. En particular, los restos 2,6-diaminoglucosa y 3,4,6-trihidroxifenilo de la pradimicina A desempeñan funciones cruciales en la unión al N-glicano. Además, los experimentos de SPR confirmaron la interacción directa entre la pradimicina A y el N-glicano. En general, nuestro estudio proporciona información sobre los mecanismos moleculares que subyacen a la actividad antiviral de la pradimicina A y destaca su potencial como compuesto principal para el desarrollo de nuevos inhibidores de la entrada del SARS-CoV-2.
