Los primeros científicos utilizaron una variedad de características observables Agrupar organismos en Phyla y clases. Estas características se basaron principalmente en características morfológicas (apariencia física y estructura) y similitudes anatómicas .

Aquí hay algunos ejemplos de las observaciones utilizadas:

* Anatomía externa:

* Forma del cuerpo: ¿El organismo fue esférico, alargado, plano o segmentado?

* Número de extremidades: ¿El organismo tenía piernas, alas o aletas?

* Presencia de características externas: ¿El organismo tenía antenas, escamas, plumas o piel?

* Anatomía interna:

* Estructura esquelética: ¿El organismo tenía una columna vertebral (vertebrado) o un exoesqueleto (invertebrado)?

* Sistema digestivo: ¿Qué tipo de sistema digestivo poseía el organismo?

* Sistema reproductivo: ¿Cómo se reprodució el organismo?

* Características fisiológicas:

* Movimiento: ¿El organismo nadó, voló, caminó o se arrastró?

* Hábitos de alimentación: ¿Era el organismo un herbívoro, carnívoro u omnívoro?

* Ciclo de vida: ¿Cuáles fueron las etapas del ciclo de vida del organismo?

Es importante tener en cuenta que las clasificaciones tempranas se basaron principalmente en rasgos visibles , y no tuvo en cuenta las relaciones genéticas o Historia evolutiva , que son factores clave en los sistemas de clasificación modernos.

A medida que progresaba el conocimiento científico y la comprensión de la evolución, los criterios para agrupar organismos se volvieron más sofisticados, lo que llevó al desarrollo de la clasificación filogenética , que considera relaciones evolutivas y similitudes genéticas.