* bacterias: Muchas bacterias, especialmente aquellas que viven en ambientes pobres en oxígeno, dependen de la respiración anaeróbica.
* Archaea: Al igual que las bacterias, algunas arqueas utilizan la respiración anaeróbica para generar energía.
* levadura: La levadura es un tipo de hongo que puede realizar la respiración aeróbica y anaeróbica, este último conocido como fermentación.
* parásitos: Algunos organismos parásitos, como el gusano redondo parásito *Ascaris lumbricoides *, utilizan la respiración anaeróbica en entornos privados de oxígeno dentro de sus huéspedes.
* células musculares (en animales): Durante el ejercicio intenso, cuando el suministro de oxígeno es limitado, las células musculares pueden cambiar a la respiración anaerobia (fermentación del ácido láctico) para producir energía.
Es importante tener en cuenta que, si bien muchos organismos pueden realizar la respiración anaeróbica, no es su modo principal de producción de energía. La mayoría de los organismos prefieren la respiración aeróbica, que es mucho más eficiente en la producción de energía.