1. Estructura de proteínas:
* Estructura primaria: La secuencia de aminoácidos en la cadena de polipéptidos dicta la forma general y las propiedades químicas de la enzima.
* Estructura secundaria: La cadena de polipéptidos se pliega en hélices alfa y hojas beta, creando arreglos 3D específicos.
* Estructura terciaria: El plegamiento de estructuras secundarias en una unidad funcional compacta determina la forma final de la enzima, incluida la ubicación y la disposición del sitio activo.
* Estructura cuaternaria: Para las enzimas compuestas de múltiples cadenas de polipéptidos (subunidades), su asociación contribuye aún más a la formación del sitio activo.
2. Cadenas laterales de aminoácidos:
* El sitio activo es típicamente una ranura o bolsillo en la superficie de la enzima forrada con residuos de aminoácidos específicos.
* Estos residuos poseen propiedades químicas específicas (por ejemplo, polares, no polares, cargados, hidrófobos) que interactúan con el sustrato y facilitan la catálisis.
* Pueden formar enlaces de hidrógeno, interacciones iónicas, fuerzas de van der Waals y otros enlaces no covalentes con el sustrato.
3. Modelo de ajuste inducido:
* El sitio activo no es una estructura rígida, pero puede ajustar ligeramente su forma tras la unión del sustrato.
* Este "ajuste inducido" ayuda a optimizar las interacciones entre la enzima y el sustrato, mejorando la eficiencia catalítica.
4. Cofactores y coenzimas:
* Algunas enzimas requieren componentes adicionales no proteicos llamados cofactores o coenzimas para funcionar correctamente.
* Estas moléculas pueden unirse al sitio activo, contribuyendo a la forma general y las propiedades químicas del sitio.
5. Factores ambientales:
* El entorno de la enzima, incluido el pH, la temperatura y la resistencia iónica, puede influir en la flexibilidad y la conformación del sitio activo, lo que afecta su actividad.
En resumen, el sitio activo es un bolsillo formado con precisión en la superficie de la enzima que resulta de la intrincada interacción de la estructura primaria, secundaria, secundaria, terciaria y quaternaria de la enzima, las cadenas laterales de aminoácidos específicas, el mecanismo de ajuste inducido y la presencia de coenzimas o coenzimas. Es un ejemplo notable de la compleja organización y funcionalidad de las moléculas biológicas.
