Lo logró en 1876 con su trabajo en Anthrax . Aisló la bacteria * Bacillus anthracis * de animales infectados y demostró que podría causar la enfermedad cuando se inyecta en animales sanos. Este fue un descubrimiento histórico porque estableció la teoría de la enfermedad gérmica .
Vale la pena señalar que Louis Pasteur, un contemporáneo de Koch, también hizo contribuciones significativas a la comprensión de las enfermedades infecciosas. Fue el primero en demostrar que los microorganismos causan fermentación y que estos organismos podrían ser asesinados por el calor. Sin embargo, fue Koch quien definitivamente vinculó un microorganismo específico con una enfermedad específica a través de su meticuloso enfoque experimental.