1. Registro fósil: Los fósiles proporcionan un registro directo de vida en la Tierra durante millones de años. Vemos patrones claros de cambio en los organismos a lo largo del tiempo, con formas de vida más simples que aparecen anteriormente en el registro geológico y las formas más complejas emergen más adelante. Por ejemplo, el registro fósil muestra la transición de los peces a los anfibios, los reptiles a los mamíferos y la evolución de los caballos de pequeños ancestros de múltiples dedos a los animales grandes y de punta individual que conocemos hoy. Esta progresión de fósiles proporciona evidencia convincente de que la vida ha cambiado con el tiempo, apoyando la idea de la evolución.

2. Estructuras homólogas: Estas son estructuras que se encuentran en diferentes especies que comparten una anatomía subyacente común, a pesar de tener diferentes funciones. Un ejemplo clásico es la estructura ósea en las extremidades anteriores de los vertebrados:humanos, gatos, murciélagos y ballenas comparten una disposición ósea similar en sus extremidades anteriores, a pesar de que estas extremidades se usan para actividades muy diferentes (agarrar, caminar, volar, nadar). Esta similitud apunta a un antepasado común, lo que indica que estas especies descendieron de un linaje compartido. La presencia de estructuras homólogas respalda fuertemente la idea de descendencia común y cambio evolutivo.