El diafragma de un microscopio generalmente está ubicado debajo de la platina, donde controla la cantidad de luz que pasa a través de la muestra y sube por el tubo del microscopio hasta los oculares o la cámara. Se utiliza para ajustar el brillo y el contraste de la imagen vista a través del microscopio.

Algunos microscopios pueden tener múltiples diafragmas, como un diafragma de campo y un diafragma de iris. Estos diafragmas se pueden ajustar para controlar el tamaño y la forma del haz de luz, así como la cantidad de luz que pasa a través de él, lo que permite un control más preciso de la calidad de la imagen y la visibilidad de las características de la muestra.