La base funcional de un microscopio es la parte que alberga los controles del microscopio y proporciona estabilidad al microscopio. La base de funciones normalmente incluye un interruptor de encendido, control de intensidad y perillas de enfoque. También puede incluir un escenario, que es una plataforma donde se coloca la muestra, y un condensador, que es una lente que enfoca la luz sobre la muestra. La base funcional suele tener una base pesada y estable que evita que se mueva cuando el microscopio está en uso.