Autores:
* Juan Smith
* Jane Doe
*Michael Jones
Afiliaciones:
* Departamento de Biología Vegetal, Universidad de California, Davis
* Departamento de Ecología y Biología Evolutiva, Universidad de Arizona
Resumen:
Las plantas invasoras son una gran amenaza para los ecosistemas naturales en todo el mundo. Pueden superar a las plantas nativas por recursos, como agua y luz solar, y también pueden alterar la química del suelo y la hidrología de un área. Esto puede tener un impacto devastador en las comunidades de plantas nativas y los animales que dependen de ellas.
Uno de los factores clave que permite que las plantas invasoras tengan éxito es su capacidad para adaptarse a nuevos entornos. Esto suele deberse a cambios en la expresión genética, que pueden provocar cambios en los rasgos de las plantas, como la tasa de crecimiento, el tamaño de las hojas y la estructura de las raíces.
Para comprender cómo las plantas invasoras se adaptan a nuevos entornos, necesitamos tener una comprensión detallada de su transcriptoma. El transcriptoma es el conjunto de todas las moléculas de ARN producidas por una célula. Al estudiar el transcriptoma, podemos identificar los genes que se expresan y cómo cambia su expresión en respuesta a diferentes condiciones ambientales.
En este estudio, reunimos el transcriptoma de una maleza nociva, Centaurea maculosa. _DO. maculosa_ es originaria de Europa y Asia que se ha vuelto invasora en América del Norte. Es una gran amenaza para las comunidades de plantas nativas en el oeste de los Estados Unidos, donde puede formar rodales densos que excluyen a otras plantas.
Utilizamos una combinación de RNA-seq y ensamblaje de novo para generar un ensamblaje de transcriptoma de alta calidad para _C. maculosa_. El conjunto contiene más de 100.000 transcripciones, que representan la gran mayoría de los genes que expresa la planta.
También realizamos un análisis de expresión genética diferencial para identificar los genes que se expresan diferencialmente entre _C. maculosa_ plantas que se cultivaron en diferentes ambientes. Descubrimos que varios genes se expresaban diferencialmente entre plantas que se cultivaban en un jardín común y plantas que se cultivaban en un entorno de campo. Es probable que estos genes estén involucrados en la respuesta de la planta a diferentes condiciones ambientales.
El ensamblaje del transcriptoma y el análisis diferencial de la expresión génica que hemos generado en este estudio proporcionan nuevos recursos valiosos para estudiar cómo _C. maculosa_ y otras plantas invasoras se adaptan a nuevos entornos. Estos recursos nos ayudarán a comprender los mecanismos que permiten que las plantas invasoras tengan éxito y desarrollen nuevas estrategias para controlar su propagación.
Palabras clave:
* Montaje del transcriptoma
* Expresión genética
* Plantas invasoras
* _Centaurea maculosa_
