Por mucho tiempo, Los gomphotheres se consideran el eslabón clave en la evolución proboscídea. Se les considera como la estirpe ancestral de los verdaderos elefantidos que sobreviven ahora. Los orígenes de los estegodóntidos, Se cree que los rhynchotheres y cuvieroniines están más o menos relacionados con los gomphotheres. Sin embargo, Los gomphotheres también se consideran un taxón problemático o una categoría de "cubo de basura" en los proboscidios. Históricamente, al menos 60 especies han sido atribuidas al género Gomphotherium o sus sinónimos, y ahora se reconocen ampliamente más de 10 especies. Aún no se ha llegado a un acuerdo sobre si estas especies tienen sinónimos u homónimos y sobre las relaciones sistemáticas entre especies. La razón es que Gomphotherium tiene pocas autapomorfias (la única autapomorfia reconocida son los incisivos inferiores ovalados o en forma de pera), característica no especializada de los dientes de las mejillas, y variación intraespecífica bastante grande.

En el número 3, volumen 37 de Revista de Paleontología de Vertebrados publicado el 11 de agosto de 2017, como historia de portada, Los logros más recientes en Gomphotherium fueron publicados por el grupo del profesor WANG Shi-Qi en IVPP, Academia china de ciencias. El autor estudió 16 especies representativas de Eurasia, África y América, que cubría casi todas las especies de Gomphotherium del mundo. En el papel, los autores amplían los logros en Gomphotherium realizados por el famoso erudito, El profesor Pascal Tassy del Museo Nacional de Historia Natural (Francia) en 1985 y comparó cuidadosamente las características morfológicas integrales del cráneo de Gomphotherium, mandíbula, incisivos y muelas; sobre esta base, a través del enfoque de análisis cladístico, Se identifican 3 grupos monofiléticos y 1 grupo parafilético dentro del género Gomphotherium, que estableció bien la relación filogenética entre las especies de Gomphotherium.

En este papel, el autor describió una nueva especie de Gomphotherium:Gomphotherium tassyi, descubierto en la Cuenca de Linxia a finales del Mioceno Medio. La nueva especie lleva el nombre del profesor Pascal Tassy para rendir homenaje a sus grandes logros en la investigación sobre gomfoterios. El estudio muestra que, Gomphotherium tassyi y Gomphotherium subtapiroideum constituyen la rama de gomphotheres cuyos pómulos evolucionaron hacia la acción cortante, de modo que muestran cierta similitud morfológica con las mamutidas. La existencia de tal similitud confunde la morfología dental de gomphotheres y mamutids, y hasta cierto punto sacude la comprensión de la clasificación principal Proboscidea.