Las bombas de iones de hidrógeno utilizan ATP para transportar iones de hidrógeno a través de una membrana, creando un gradiente de protones que impulsa los procesos celulares. Estas bombas contienen un canal proteico que facilita el movimiento de los iones de hidrógeno. El canal está formado por varios residuos de aminoácidos que recubren el interior de la proteína y crean un ambiente hidrofílico para el paso de iones de hidrógeno. Estos residuos tienen grupos funcionales que pueden interactuar con los iones de hidrógeno, permitiéndoles ser transportados a través de la membrana. La estructura del canal asegura el transporte específico y eficiente de iones de hidrógeno, lo que permite a la bomba mantener el gradiente de protones y respaldar las funciones celulares.