Esto lo llevó a proponer el concepto de alelos , formas alternativas de un gen, y que cada individuo hereda dos alelos para cada rasgo, uno de cada padre. También se dio cuenta de que el alelo recesivo todavía está presente en la generación F1, a pesar de que no se manifiesta. Puede reaparecer en la generación F2 cuando se cruzan dos personas F1.
Este descubrimiento de dominio fue un avance crucial para comprender cómo se transmiten los rasgos de los padres a la descendencia y pavimentaron el camino para la genética moderna.