Desarrolló un sistema de clasificación de organismos basados en sus características compartidas, que se conoce como Taxonomía Linnaean . Este sistema utiliza una clasificación jerárquica, con organismos agrupados en categorías cada vez más específicas:
* Reino
* Phylum
* clase
* orden
* familia
* género
* especies
El trabajo de Linnaeus, publicado en su libro Systema Naturae En 1735, sentó las bases del sistema moderno de clasificación biológica y todavía se usa como base para comprender las relaciones entre los seres vivos.