No hay un solo nombre científico para un microorganismo. "Microorganismo" es un término general que se refiere a cualquier organismo que sea demasiado pequeño para ser visto a simple vista, incluyendo:

* bacterias: p.ej. *Escherichia coli*

* virus: p.ej. *Virus de influenza*

* Fungi: p.ej. *Candida albicans*

* Protozoo: p.ej. *Plasmodium falciparum*

* algas: p.ej. *Chlamydomonas reinhardtii*

Cada uno de estos grupos tiene su propio sistema de clasificación científica con nombres específicos para especies individuales.