Los científicos han realizado estudios y comparaciones del tamaño del cerebro del Homo floresiensis con el de otras especies de homínidos, incluidos los humanos modernos. Aunque el Homo floresiensis tenía un tamaño cerebral más pequeño en comparación con el de los humanos modernos, no era desproporcionadamente pequeño en relación con su tamaño corporal.
Algunos paleoantropólogos estiman que el volumen cerebral del Homo floresiensis oscila entre 380 y 430 centímetros cúbicos, que es más pequeño en comparación con el volumen cerebral promedio de los humanos modernos, que oscila entre 1200 y 1700 centímetros cúbicos. Sin embargo, Homo floresiensis tenía un tamaño corporal relativamente pequeño, con individuos de una altura promedio de alrededor de 1,1 metros (3,5 pies).
Teniendo en cuenta su tamaño corporal, la proporción entre el tamaño del cerebro y el cuerpo del Homo floresiensis no es inusualmente pequeña en comparación con la de otros primates. Su coeficiente de encefalización estimado (EQ), que es una medida del tamaño del cerebro en relación con la masa corporal, se encuentra dentro del rango observado en otros primates, incluidos los humanos modernos.
