Un equipo de investigadores de la Universidad de California, Berkeley, ha desarrollado un nuevo método para calcular cómo interactúan las proteínas con los fármacos. El método, denominado "calculadora universal y precisa de interacción proteína-ligando" (UNAPLICA), es capaz de predecir con precisión la afinidad de unión de un fármaco a una proteína, lo cual es esencial para comprender cómo funcionan los fármacos y diseñar otros nuevos.
El método UNAPLICA se basa en un algoritmo de aprendizaje automático que se entrenó en un gran conjunto de datos de interacciones proteína-ligando. El algoritmo pudo aprender los principios generales que gobiernan cómo interactúan las proteínas y los ligandos, y ahora puede usarse para predecir la afinidad de unión de un nuevo fármaco a una proteína sin la necesidad de experimentos costosos y que requieren mucho tiempo.
Los investigadores dicen que UNAPLICA es un gran avance en el campo del descubrimiento de fármacos, ya que permitirá a los científicos evaluar rápida y fácilmente el potencial de un nuevo fármaco candidato. Esto podría conducir al desarrollo de nuevos fármacos que sean más eficaces y tengan menos efectos secundarios.
Cómo funciona UNAPLICA
El método UNAPLICA funciona generando primero un modelo tridimensional del complejo proteína-ligando. Luego, este modelo se utiliza para calcular la energía de interacción entre la proteína y el ligando, que es una medida de la fuerza con la que se unen las dos moléculas entre sí.
La energía de interacción se calcula utilizando diversos métodos, incluida la mecánica cuántica, la mecánica molecular y los campos de fuerza empíricos. Luego, el método UNAPLICA utiliza algoritmos de aprendizaje automático para aprender los principios generales que gobiernan cómo interactúan las proteínas y los ligandos. Esto permite que el método prediga la afinidad de unión de un nuevo fármaco a una proteína sin la necesidad de experimentos costosos y que requieren mucho tiempo.
Aplicaciones de UNAPLICA
El método UNAPLICA tiene una amplia gama de aplicaciones en el campo del descubrimiento de fármacos. Se puede utilizar para:
* Evalúe rápida y fácilmente el potencial de un nuevo fármaco candidato.
* Diseñar nuevos medicamentos que sean más eficaces y tengan menos efectos secundarios.
* Optimizar la dosis de un medicamento.
* Comprender cómo interactúan las drogas con otras moléculas del cuerpo.
El método UNAPLICA es una poderosa herramienta que podría conducir al desarrollo de nuevos fármacos más eficaces y con menos efectos secundarios. Esto podría tener un impacto importante en la salud y el bienestar de las personas en todo el mundo.
