Con el desarrollo de tecnologías de secuenciación del genoma, se han identificado muchos ARN largos no codificantes (lncRNA) en frutas y verduras. Una extensa investigación sobre los lncRNA ha revelado su papel en la regulación de la expresión de genes codificadores de proteínas tanto a nivel transcripcional como postranscripcional, desempeñando así funciones cruciales en el crecimiento, el desarrollo y las respuestas al estrés en frutas y verduras.
Una nueva revisión publicada en Horticulture Research proporciona un resumen completo de la comprensión actual de la formación, las características funcionales y los mecanismos reguladores de los lncRNA en frutas y verduras.
Según su dirección de transcripción y su posición en relación con los genes codificadores de proteínas, los lncRNA se clasifican en cuatro tipos:lncRNA intergénicos (lincRNA), transcripciones antisentido largas no codificantes (lncNAT), lncRNA sentido y lncRNA intrónicos (incRNA). En este artículo se describe la formación y las características básicas de los lncRNA en frutas y verduras desde tres aspectos:abundancia y tamaño, estructura y localización, descomposición y evolución.
Las funciones de los lncRNA en frutas y verduras se han resumido y discutido exhaustivamente en informes de investigación recientes, cubriendo varios aspectos que incluyen la acumulación de pigmentos, el desarrollo de los órganos reproductivos, la maduración de la fruta, así como las respuestas a la deficiencia de nutrientes, la sal, la sequía, la temperatura y las bacterias patógenas. .
Además, los autores han dilucidado los mecanismos reguladores de los lncRNA en la regulación transcripcional de genes y el empalme alternativo, así como las interacciones entre los lncRNA y hormonas vegetales, factores de transcripción y miRNA.
El desarrollo de la tecnología de secuenciación de alto rendimiento ha mejorado enormemente la capacidad de descubrir, predecir e identificar lncRNA. Sin embargo, sigue habiendo una escasez de datos completos de análisis de lncRNA en bases de datos de plantas relacionados con lncRNA en frutas y verduras, lo que dificulta la caracterización de la expresión y localización de lncRNA.
Además, el costo asociado con los experimentos de localización subcelular de lncRNA, como FISH, plantea una limitación a los estudios de lncRNA, lo que resalta la necesidad urgente de desarrollar métodos más asequibles para la investigación de lncRNA.
La exploración de la función y el mecanismo de los lncRNA en cultivos de frutas y hortalizas aún se encuentra en sus primeras etapas, y el rápido desarrollo de la tecnología traerá nuevas oportunidades y avances para la investigación de lncRNA en frutas y hortalizas.
Más información: Xiuming Zhao et al, Funciones y mecanismos emergentes de los lncRNA en frutas y hortalizas, Investigación en horticultura (2024). DOI:10.1093/hora/uhae046
Información de la revista: Investigación en horticultura
Proporcionado por la Academia China de Ciencias