Utilizando un análisis de eDNA de amplio alcance combinado con métodos tradicionales de encuestas de recopilación, Investigadores japoneses han identificado el sitio de reproducción de especies de peces en peligro crítico de extinción Acheilognathus typus en la corriente principal del río Omono en la prefectura de Akita. Japón. Los hallazgos fueron publicados el 14 de noviembre en la edición en línea de La ciencia de la naturaleza - Naturwissenschaften .

La prospección de organismos acuáticos es un proceso largo y laborioso, y cubrir un área amplia también conlleva altos costos. El análisis de ADN ambiental (eDNA) proporciona una solución a estos problemas. En entornos submarinos como lagos, embalses y ríos, podemos encontrar fragmentos de ADN a la deriva en el agua de las heces, piel o cualquier otra fuente de organismos acuáticos. El análisis de eDNA es particularmente eficaz para especies raras como A. typus, que es difícil de encontrar a través de los métodos tradicionales de encuesta debido a su baja densidad de población. En este estudio, el equipo de investigación llevó a cabo una encuesta de ADN electrónico de amplio alcance seguida de una encuesta de recolección tradicional para encontrar el nuevo hábitat de reproducción de A. typus en el río Omono, Prefectura de Akita, Japón.

Durante tres días en agosto de 2016, el equipo recolectó muestras de agua superficial de 99 ubicaciones, que cubre 112 km del río Omono, y extrajo eDNA de las muestras. Midieron el ADN utilizando un sistema de detección específico para A. typus. Después de este, colocaron redes fijas y trampas de botella en los lugares donde se había detectado el eDNA y confirmaron la presencia de peces adultos. El equipo también usó bivalvos (donde A. typus pone huevos) para confirmar que se estaban reproduciendo.

En las 99 ubicaciones del río Omono encuestadas, A. typus eDNA se encontró en 2 lugares, y en uno de estos lugares, el equipo capturó un espécimen macho y una hembra. Se encontraron huevos en el bivalvo en el mismo lugar, por lo que pudieron identificarlo con éxito como el sitio de reproducción de A. typus.

Estos hallazgos demuestran que en términos de costo y confiabilidad, una combinación de análisis de eDNA y métodos de recolección tradicionales es muy eficaz para identificar los hábitats y las áreas de reproducción de especies raras. Los métodos se complementan entre sí:el método eDNA es adecuado para topografía de áreas amplias, mientras que la recolección de muestras es muy confiable para confirmar especies. Esta combinación de métodos podría ayudar a conservar esta especie al encontrar más áreas de reproducción y establecer áreas de conservación. También podría usarse para otras especies raras y en peligro de extinción con una baja densidad de población distribuidas en un área amplia.