El modelado informático ha ayudado a un equipo de científicos a incluidos varios académicos de la Universidad de Chicago, para decodificar detalles previamente desconocidos sobre el proceso por el cual el VIH obliga a las células a propagar el virus a otras células. Los resultados, publicado el 7 de noviembre en procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias , puede ofrecer una nueva vía para que los medicamentos combatan el virus.

Una parte clave del éxito del VIH es un pequeño truco desagradable para propagarse dentro del cuerpo. Una vez que el VIH ha infectado una célula, obliga a la célula a hacer una pequeña cápsula con su propia membrana, lleno del virus. La cápsula se desprende, un proceso llamado "gemación", y se aleja flotando para infectar más células. Una vez dentro de otra celda desprevenida, el revestimiento de la cápsula se deshace, y el ARN del VIH se pone a trabajar.

Los científicos sabían que la gemación implica un complejo de proteínas del VIH llamado proteína Gag, pero los detalles del proceso molecular eran confusos. "Desde hace un tiempo hemos tenido una idea de cómo se ve la estructura ensamblada final, pero todos los detalles intermedios permanecieron en gran parte desconocidos, "dijo Gregory Voth, el Profesor de Química con Servicio Distinguido Haig P. Papazian y autor correspondiente del artículo.

Dado que ha sido difícil obtener una buena instantánea a nivel molecular del complejo proteico con técnicas de imagen, Voth y su equipo construyeron un modelo de computadora para simular a Gag en acción. Las simulaciones les permitieron ajustar el modelo hasta que llegaron a las configuraciones más probables para el proceso molecular, que luego fue validado por experimentos en el laboratorio de Jennifer Lippincott-Schwartz en los Institutos Nacionales de Salud y el Campus de Investigación Janelia del Instituto Médico Howard Hughes.

Construyeron un modelo de partes faltantes del complejo de proteínas Gag, y lo modificaron hasta que pudieron ver cómo se ensamblan las proteínas aprovechando la infraestructura celular en preparación para el proceso de gemación.

"Realmente demuestra el poder de la informática moderna para simular virus, "Dijo Voth.

"La esperanza es que una vez que tenga un talón de Aquiles, se puede fabricar un medicamento para detener la acumulación de mordaza y, con suerte, detener la progresión del virus ".

El equipo planea a continuación estudiar las estructuras de las proteínas Gag en la cápsula del virus del VIH después de la gemación. él dijo.