Con Halloween terminado hoy es tradicionalmente el día en que salen las decoraciones navideñas, por lo que es apropiado que un animal icónico asociado con la festividad esté dando un salto en el espíritu navideño al unirse a la lista de especies para secuenciar su genoma. Publicado hoy en la revista de acceso abierto GigaScience , es un artículo que describe la secuenciación y el análisis del genoma del reno. Este trabajo, aunque es poco probable que revele por qué el reno de Santa puede volar, proporciona un gran recurso para obtener una mayor comprensión de los procesos de evolución, domesticación, la cría de animales, y adaptación a ambientes extremos.

El reno Rangifer tarandus ) es la única especie completamente domesticada del ciervo, o cérvido, familia. También es el único ciervo que tiene una distribución mundial:abarcando boreal, tundra, subártico, regiones árticas y montañosas del norte de Asia, América del Norte y Europa. A diferencia de todos los demás cérvidos, no es solo el ciervo macho el que crece y muda las astas, pero también las hembras. Desde el punto de vista de la cría de animales, La leche de reno es mucho más rica en proteínas y tiene menos lactosa que la leche de vaca. Este último aspecto hace que la disponibilidad de esta leche sea de interés dado el alto porcentaje de personas intolerantes a la lactosa en el mundo. Con esta variedad de características únicas, la disponibilidad de una secuencia del genoma del reno puede proporcionar un trineo completo de nueva información, y es un nuevo miembro bienvenido al club de élite de especies domesticadas con genomas de referencia, incluida la vaca, ovejas y cabras.

Este trabajo fue realizado por un equipo de investigadores chinos de la Academia China de Ciencias Agrícolas en Changchun y la Universidad Politécnica del Noroeste en Xi'an. Los investigadores tomaron una muestra de sangre de un niño de dos años, reno hembra de una manada domesticada mantenida por cazadores-pastores nómadas Ewenki en las montañas del Gran Khingan en China. Ellos secuenciaron, ensamblado anotó el genoma y demostró que era de alta calidad. Comparación del genoma del reno con los genomas de especies relacionadas y con los humanos, reveló que el tamaño del genoma del reno (2,6 GB o 2,6 mil millones de pares de bases) es ligeramente más pequeño que el de los humanos, vacas y cabras, y aproximadamente del mismo tamaño que una oveja.

El primer autor del artículo, Zheping Li, profesor asociado en el Instituto de Ciencias Especiales de Animales y Plantas de la Academia China de Ciencias Agrícolas, señaló que el análisis también identificó "335 genes específicos de renos que probablemente ayuden a comprender las características biológicas especiales de los renos. Estos también podrían ser muy útiles para comprender la evolución de los renos, así como de toda la familia Cervid en la genómica comparativa futura estudios entre renos y otros rumiantes ".

Con este objetivo en mente, los investigadores también construyeron un árbol evolutivo utilizando el nuevo genoma y los genomas ya disponibles de miembros de la familia bovina. Encontraron ese reno vacas, y las cabras se separaron de un ancestro común hace aproximadamente 29,6 millones de años. Esto fue durante la época del Oligoceno, donde uno de los principales cambios fue la expansión global de los pastizales.

Este artículo fue uno de los ganadores de la inauguración GigaScience competencia y pista de premios que se utiliza para promover nuevos, innovador, investigar. Los autores presentaron su trabajo en una sesión especial en la 12ª Conferencia Internacional Anual de Genómica de BGI en Shenzhen el viernes 27 de octubre. Como concurso de ciencia abierta, este y los demás artículos de los ganadores se revisaron de forma totalmente abierta. donde el público podría seguir todo el proceso de publicación al tener el borrador del artículo disponible abiertamente en el servidor de preimpresión de Biorxiv, el proceso de revisión por pares realizado en vivo con revisiones disponibles antes de la decisión de publicación en el sistema de revisión de superposición de Karma académico, seguido de decisiones editoriales, revisiones de manuscritos y publicación de artículos con todos los editores, autor, y correspondencia del revisor disponible con el artículo publicado.