A primera vista, la levadura Candida krusei parece tan inofensiva como los microbios:se utiliza para fermentar los granos de cacao y le da al chocolate su agradable aroma. Pero se encuentra cada vez más como patógeno en pacientes inmunodeprimidos, y las infecciones por C. krusei no siempre son fáciles de curar. Esta levadura es naturalmente resistente al fluconazol, un antimicótico de primera línea que es vital no solo para tratar muchas infecciones por hongos, sino también para prevenirlas en poblaciones susceptibles. En la edición de septiembre de G3 , Cuomo y col. revelar la primera secuencia del genoma completo de una muestra clínica de C. krusei, proporcionando pistas sobre genes que pueden ser importantes para la resistencia de la especie al fluconazol.

Algunos borradores de conjuntos del genoma de C. krusei se habían producido antes del trabajo de estos investigadores, pero estaban fragmentados, un problema causado por una gran cantidad de heterocigosidad. La clave de su éxito fue generar lecturas de secuenciación largas, produciendo un ensamblaje con no muchos más andamios de los que C. krusei tiene cromosomas.

Con su nuevo borrador en la mano, Brand y col. buscó en el C. kruseigenoma genes asociados con la patogénesis en la Candida albicans más conocida, la causa de la candidiasis, infecciones vaginales por hongos, ya veces infecciones sistémicas potencialmente letales. C. krusei, ellos encontraron, tiene pocas copias de familias de genes asociadas con la patogenia en C. albicans, incluidos los transportadores de oligopéptidos, aspartil proteasas, y genes de fosfolipasa B. Las especies de Candida que a menudo causan enfermedades suelen tener expansiones en estas familias de genes, así que dado que C. krusei rara vez es patógeno, este hallazgo tiene sentido.

Cuando se enfocaron en genes involucrados en la resistencia a los medicamentos, el grupo encontró que C. krusei difiere de C. albicans; muchos de los sitios que a menudo están mutados en la diana de los fármacos azoles en C. albicans resistente no están mutados en C. krusei. Esto implica que la resistencia natural de la levadura fermentadora de cacao al fluconazol surge de un mecanismo diferente al que comúnmente permite que C. albicans resista los fármacos azoles.

Los investigadores tampoco encontraron el gen MDR1, que codifica un transportador de fármacos a menudo responsable de la resistencia a múltiples fármacos. Lo hicieron, sin embargo, encontrar copias de genes relacionados con CDR1, CDR2, y algunos otros que codifican otros transportadores asociados con la resistencia a los medicamentos, aunque se desconoce la forma en que funcionan en C. krusei. Estos genes podrían ser un punto de partida para descubrir los mecanismos detrás de la resistencia a los antifúngicos en C. krusei, potencialmente conduciendo a mejores tratamientos y medidas preventivas para poblaciones altamente vulnerables.