* Los acuíferos confinados se encuentran entre dos capas de roca impermeable, mientras que los acuíferos libres no lo están. Esto significa que los acuíferos confinados están protegidos de la contaminación por aguas superficiales y contaminantes. Los acuíferos libres, por otra parte, son más susceptibles a la contaminación porque están directamente expuestos a la superficie.
* Los acuíferos confinados suelen estar bajo presión, mientras que los acuíferos libres no. Esta presión es causada por el peso de las capas de roca sobre el acuífero. La presión en un acuífero confinado puede ayudar a impulsar el agua a través de pozos y manantiales. Los acuíferos libres, por el contrario, no tienen esta presión, por lo que es necesario bombear agua desde ellos.
* Los acuíferos confinados se pueden encontrar a cualquier profundidad, mientras que los acuíferos libres se encuentran normalmente cerca de la superficie. Esto se debe a que los acuíferos libres se recargan con agua superficial, por lo que deben ubicarse cerca de la superficie para poder recibir esta recarga. Los acuíferos confinados, por otro lado, pueden encontrarse a cualquier profundidad, siempre que haya una capa de roca impermeable encima de ellos para protegerlos de la contaminación.
En general, los acuíferos confinados proporcionan una fuente de agua más confiable y protegida que los acuíferos libres. Sin embargo, los acuíferos libres suelen ser más accesibles y menos costosos de desarrollar.