* D-Galactosa (un azúcar de seis carbono)
* 3,6-anhidro-l-galactosa (un azúcar modificado de seis carbono)
Estas unidades de agarobiose están unidas por α- (1 → 3) y β- (1 → 4) enlaces glucosídicos .
Además de la estructura de agarobiose principal, la agarosa también puede contener pequeñas cantidades de otros azúcares como sulfato , ácidos urónicos , y ácido piruvico así como proteínas y sales .
La presencia de estos componentes adicionales puede variar según la fuente de las algas de la cual se extrae la agarosa, lo que resulta en ligeras variaciones en las propiedades físicas de la agarosa.