Investigadores de la Universidad Estatal de Carolina del Norte han creado un nuevo servicio en línea, ChemMaps, que permite a los usuarios navegar de forma interactiva por el espacio químico de más de 8, 000 medicamentos y 47, 000 compuestos ambientales en 3-D y en tiempo real. ChemMaps está diseñado para ser un recurso central para estudiantes e investigadores que desean visualizar y estudiar fácilmente conjuntos complicados de estructuras químicas.

La primera versión del sitio web de uso gratuito está disponible en http://www.chemmaps.com.

"La premisa de ChemMaps era convertirlo en Google Maps de medicamentos, "dice Denis Fourches, profesor asistente de química en NC State. "Permite a cualquier persona que utilice una computadora o tableta navegar y navegar fácilmente por el espacio químico de los medicamentos comercializados en un entorno 3-D. Realmente queríamos que la interfaz gráfica en ChemMaps fuera relevante para un estudiante o un especialista en química médica. "

Con ChemMaps, los productos químicos parecen estrellas:puntos de luz esparcidos por la pantalla. Cada estrella o compuesto, se posiciona en relación con los demás dentro del complejo espacio químico en función de sus propiedades estructurales. Cuando un usuario hace clic en una estrella compuesta en particular, Se muestran varias características clave de esa sustancia química:su nombre sistemático, nombre de la marca, Estructura química, indicación médica, identificadores externos, y otras propiedades fisicoquímicas.

En la actualidad, hay dos mapas principales disponibles. El DrugMap incluye alrededor de 8, 000 medicamentos (comercializados, en desarrollo y retirado) y se preparó a partir de la base de datos de DrugBank. El mapa medioambiental, o EnvMap, incluye más de 47, 000 compuestos (como pesticidas o retardadores de llama) de relevancia para el Instituto Nacional de Estudios de Salud Ambiental (NIEHS) y la Agencia de Protección Ambiental de los Estados Unidos (EPA) y fue preparado a partir de Tox21, Toxcast, y otras bases de datos del NIEHS.

Los investigadores planean agregar funciones con el tiempo, incluida la capacidad de los colaboradores y las empresas de visualizar y proyectar conjuntos de productos químicos patentados en los ChemMaps. También planean hacer que los mapas sean aún más interactivos, fácil de manipular, y compatible con dispositivos de realidad aumentada y virtual.

"Esta es la primera herramienta de dominio público que permite a cualquiera, particularmente los no expertos en quimioinformática, fácilmente acceder de forma visual y rápida a toda esta compleja información química en un solo lugar, "Dice Fourches." Esta herramienta podría ayudar a los investigadores a comprender mejor la vecindad química de un compuesto en particular. De hecho, esto es fundamental para la reutilización de fármacos o la evaluación de riesgos químicos ".

La investigación aparece en Bioinformática . Dr. Alex Borrel, ex becario postdoctoral de NC State actualmente en el NIEHS y primer autor del artículo, creado el programa. Fourches concibió ChemMaps y es autor correspondiente. Dra. Nicole Kleinstreuer, biólogo computacional del NIEHS, también contribuyó al trabajo.