Investigadores en Japón han creado una base de datos de metabolitos a partir de muestras de sangre recolectadas de más de 5, 000 voluntarios japoneses, haciéndolo disponible gratuitamente en línea como un recurso valioso para los investigadores de todo el mundo.

Los metabolitos y las proteínas controlan muchos de los procesos dentro de nuestro cuerpo, y también informar la interacción entre nuestras células y su entorno. Entender mejor estos compuestos y cómo se relacionan entre sí, podría ayudar a los investigadores a evaluar el estado de salud de las personas y desarrollar nuevos tratamientos personalizados para diversas enfermedades.

La base de datos, que el científico de bioinformática Shu Tadaka de la Universidad de Tohoku y sus colegas llamaron jMorp, contiene información sobre 306 metabolitos y 256 proteínas comunes que se encuentran en los seres humanos. Esto incluye su frecuencia, concentración, y con qué frecuencia aparecieron en hombres o mujeres y a qué edad. La base de datos es única en eso, en lugar de solo mostrar datos sin procesar, ofrece a los visitantes la oportunidad de ver cómo los diferentes metabolitos se correlacionan entre sí gráficamente, allanando el camino para más estudios para identificar cómo estos metabolitos y proteínas se relacionan entre sí.

"La información en jMorp se obtiene a partir de datos estadísticos creados agregando datos individuales, ", dice Tadaka." Un comité independiente ha considerado cuidadosamente todas las cuestiones éticas antes de permitirnos el acceso a estos datos ".

Bases de datos similares cubren otros países o regiones, como el Reino Unido y la República de Irlanda, pero algunos tienen limitaciones debido a la recopilación de datos inconsistente o al tamaño pequeño de la muestra. La gran cantidad de personas sanas que contribuyeron con muestras a jMorp lo hace particularmente útil. Los investigadores también recopilaron y analizaron datos utilizando el mismo método y en el mismo instituto, lo que minimiza los errores de medición. Además, tomaron medidas adicionales para excluir cualquier muestra de baja calidad y para garantizar el control de calidad en todos los procesos de recolección, almacenar y analizar las muestras de plasma. Esto hace que jMorp sea especialmente confiable como recurso para los científicos, especialmente bioquímicos e investigadores médicos.

Para que sea relevante y útil para otros investigadores, el equipo japonés ha configurado jMorp en un formato fácil de usar que permite a los visitantes acceder a los datos que necesitan fácilmente, así como extraer comparaciones y relaciones entre diferentes compuestos mostrados visualmente. Los usuarios pueden buscar el tipo de compuesto que buscan, ya sea por nombre o por especificaciones. El resumen de los datos se puede descargar y los gráficos de correlación se pueden guardar como archivos de imagen.

La base de datos es un esfuerzo continuo y los investigadores producen versiones anuales actualizadas a medida que recolectan y analizan más muestras. También planean ofrecer más información sobre los metabolitos y las proteínas que documentan mediante la aplicación de nuevos métodos de análisis.