Un nuevo sitio web de código abierto diseñado por el MIT bien podría ser el Pinterest de microfluidos. El sitio, Metafluidics.org, es un repositorio gratuito de diseños para dispositivos lab-on-a-chip, presentado por todo tipo de inventores, incluidos científicos e ingenieros capacitados, aficionados, estudiantes, y fabricantes de aficionados. Los usuarios pueden navegar por el sitio en busca de dispositivos que van desde clasificadores de células simples y mezcladores de fluidos, a chips más complejos que analizan el líquido ocular y sintetizan secuencias de genes.

El sitio también sirve como plataforma social para la comunidad de microfluidos:cualquier usuario puede iniciar sesión para enviar un diseño; también les puede gustar, comentar sobre, y descargar archivos de diseño para reproducir un dispositivo destacado o mejorarlo.

David S. Kong, director de la nueva Iniciativa de Biotecnología Comunitaria del MIT Media Lab, dice que el nuevo sitio está diseñado para acelerar la innovación en el diseño de microfluidos, que hasta ahora ha seguido un convencional, ruta académicamente revisada por pares.

"Existe una experiencia familiar para las personas en microfluidos:ves un papel realmente asombroso que muestra un diseño, pero si quieres intentar copiar el diseño, los archivos de diseño reales que son una parte crítica de la reproducción o remezcla de un dispositivo no se comparten de manera sistemática, Kong dice. Como resultado, En paralelo, investigadores de todo el mundo están reinventando la rueda. Es una de las razones por las que el código abierto en general es un conjunto de principios muy poderoso. Realmente puede acelerar la difusión de la tecnología ".

Kong y sus colegas describieron la plataforma de código abierto en un artículo publicado la semana pasada en la revista. Biotecnología de la naturaleza . Sus coautores son Todd Thorsen, Peter Carr, y Scott Wick del Laboratorio Lincoln del MIT; Jonathan Babb y Jeremy Gam en el Departamento de Ingeniería Biológica; y Ron Weiss, profesor de ingeniería biológica y de ingeniería eléctrica e informática.

Un ecosistema abierto

Los investigadores modelaron su sitio Metafluidics a partir de repositorios populares de código abierto como GitHub, un sitio gratuito que aloja proyectos de software de código abierto, y Thingiverse, un sitio web que presenta archivos de diseño de hardware para juguetes creados por usuarios, artilugio, y robots.

Kong tuvo la idea de Metafluidics como biólogo sintético en el Laboratorio Lincoln, donde trabajó para combinar fragmentos de ADN para reprogramar nuevas funciones en células vivas. Para hacerlo Hizo uso regular de repositorios de ADN como el GenBank de los Institutos Nacionales de Salud, una base de datos disponible públicamente a través de la cual los científicos pueden compartir y acceder a secuencias genéticas y sus funciones asociadas.

"Ha habido bastante intercambio de diferentes tipos de información en torno a la biología sintética, Kong observa. "Así que este tipo de movimiento de código abierto más amplio en biotecnología es importante, y esperamos llenar esta parte clave del ecosistema que está específicamente relacionada con el hardware ".

Curación de chips

El equipo trabajó con Bocoup, una empresa de consultoría de software de código abierto, diseñar una plataforma de código abierto para compartir diseños de microfluidos. Para acceder al sitio gratuito, los usuarios completan un breve perfil para iniciar sesión, después de lo cual pueden navegar a través de dispositivos destacados o buscar en el sitio funciones microfluídicas específicas.

Cada dispositivo subido al sitio incluye una breve descripción, junto con una lista de materiales utilizados para fabricar el chip, y sus archivos de diseño asociados, como dibujos de diseño asistido por computadora (CAD).

"Microfluidos de papel, Chips de litografía blanda y impresos en 3D, todas estas técnicas requieren que el archivo de diseño digital, ", Dice Kong." Eso es lo clave que estamos poniendo a disposición por primera vez para la comunidad en general ".

El sitio actualmente está poblado con diseños presentados por estudiantes y aficionados junto con los principales expertos en el campo como Thorsen, quien ha contribuido con varios publicados anteriormente, dispositivos muy citados y los planos para reproducirlos.

"Estamos llegando a los principales pioneros y líderes en el campo más amplio y seleccionando colecciones de sus archivos de diseño, Kong dice:"Con suerte, esto inspirará a la gente a fabricar la próxima generación de piezas [de microfluidos]".

El sitio está gestionado por un equipo editorial, incluyendo a Nina Wang, un estudiante de segundo año en ingeniería biológica en el MIT, y Kong, que está trabajando para crear conciencia sobre el sitio dentro de la comunidad de microfluidos. Finalmente, a medida que las personas cargan más dispositivos, el equipo planea resaltar ciertos diseños como, por ejemplo, una "Parte de la semana".

"Con el tiempo, también queremos iniciar desafíos:¿quién puede hacer el clasificador de partículas más rápido? ¿Quién puede fabricar dispositivos que puedan cultivar un cierto tipo de microbio intestinal?" Kong dice. "Mi opinión es que la innovación en su conjunto se beneficia cuando hay comunidades diversas involucradas y hay una enorme cantidad de apertura".

Una democracia de microfluidos

Los investigadores enviaron un dispositivo novedoso al sitio para demostrar el potencial de la plataforma de código abierto para su uso en biología sintética. Usando piezas de microfluidos comunes y un controlador de código abierto, o sistema de válvulas, el equipo diseñó un dispositivo de ensamblaje de circuitos genéticos, un chip que combina automáticamente fragmentos de ADN para formar una nueva secuencia genética capaz de realizar una nueva función cuando está incrustado en una célula viva.

"Nuestra esperanza es, demostrando una aplicación como el ensamblaje de ADN con nuestro sistema de código abierto, esto animará a otros a reproducir nuestro sistema y mezclarlo para aplicaciones que son fundamentales para la biología sintética, "Dice Kong.

A largo plazo, él prevé que el sitio "democratizará" la microfluídica e iluminará nuevas ideas de fuentes inesperadas.

"Tenemos una gran mezcla de partes, de los pioneros más avanzados en el campo, a los estudiantes que están haciendo microfluidos por primera vez, Kong dice. Existe la posibilidad de que algún estudiante desconocido de alguna otra parte del mundo desarrolle seguidores, si la comunidad de microfluidos considera que su parte es interesante o interesante ".

Esta historia se vuelve a publicar por cortesía de MIT News (web.mit.edu/newsoffice/), un sitio popular que cubre noticias sobre la investigación del MIT, innovación y docencia.