1. Doble membrana: Las mitocondrias poseen una estructura de membrana doble, con una membrana externa y una membrana interna. Esto es diferente a la mayoría de los otros orgánulos, que tienen una sola membrana. La membrana interna se plega en Cristae, aumentando su área de superficie para la producción de ATP.

2. Replicación semiautónoma: Las mitocondrias tienen su propio ADN (ADNmt) y ribosomas, lo que les permite sintetizar algunas de sus propias proteínas. Esto les permite replicarse independientemente del núcleo de la célula, un proceso conocido como fisión binaria. Si bien esta autonomía no es absoluta (todavía dependen del núcleo para algunas proteínas), los distingue de los orgánulos que dependen completamente del ADN nuclear de la célula.