Realizó una serie de elegantes experimentos en la década de 1860 usando matraces con cisne. Estos experimentos mostraron que:

* caldo estéril permaneció estéril incluso cuando se expuso al aire, siempre que el cuello de cisne impida que las partículas de polvo entraran en el caldo.

* Cuando el cuello estaba roto , permitiendo que entrara polvo, el caldo se contaminó rápidamente con microorganismos.

Esto demostró que los microorganismos no surgieron espontáneamente del caldo en sí, sino que se introdujeron en el medio ambiente, específicamente a través de partículas de polvo.

El trabajo de Pasteur revolucionó nuestra comprensión de los orígenes de la vida y sentó las bases de la teoría de la enfermedad de los gérmenes.