Esta clasificación se basó en el hecho de que ambos grupos son procariotas, lo que significa que carecen de un núcleo y otros orgánulos unidos a la membrana. Sin embargo, una investigación adicional reveló diferencias significativas en sus estructuras celulares, bioquímica y genética, lo que lleva a la separación de eubacterias (ahora simplemente bacterias) y arquebacterias (ahora simplemente arquea) en reinos separados.