Los protozoos se clasificaron tradicionalmente como un filo dentro del reino Protista, pero investigaciones recientes han demostrado que son un grupo polifilético , lo que significa que no comparten un solo antepasado común. Esto significa que no son una agrupación natural y se han reclasificado en diferentes filas basadas en relaciones evolutivas.
En lugar de un solo filo, los protozoos ahora se extienden a través de varios Phyla diferentes dentro del reino Protista, incluyendo:
* Amoebzoa: Amebas
* foraminifera: Foraminíferos
* ciliophora: Cilias
* apicomplexa: Apicomplexanos
* Radiolaria: Radiolarios
* Diplomonadida: Diplomonadas
* parabasalida: Parabasálidos
Por lo tanto, no hay un nombre científico único para "Phylum Protozoa" porque ya no es un filo válido en la clasificación moderna. En cambio, los diversos grupos que previamente se clasificaron como protozoos ahora se extienden a través de múltiples phyla diferentes dentro del reino Protista.