Mycobacterium tuberculosis, como todas las bacterias, emplea proteólisis para degradar proteínas y péptidos innecesarios, mal plegados y dañados en componentes moleculares básicos:aminoácidos. Hay dos sistemas proteolíticos esenciales (conocidos como proteasas dependientes de ATP):proteasa ClpP y proteasa Lon. Cada uno juega un papel importante y bien caracterizado en el control de la calidad de las proteínas bacterianas y el control de la virulencia en M. tuberculosis.