Recopilar datos :recopile datos de secuencias de ADN o proteínas de un grupo diverso de organismos, incluidos los organismos de interés y algunos grupos externos para comparar.
Alineación de secuencias múltiples :Alinee las secuencias para crear una alineación de secuencias múltiples. Este alineamiento debe considerar el orden y la similitud de los nucleótidos o aminoácidos.
Seleccione un método de construcción de árboles: Elija un método de construcción de árboles filogenéticos, como Máxima Verosimilitud, Unión de Vecinos o Inferencia Bayesiana. Cada método utiliza diferentes algoritmos y enfoques estadísticos para calcular las relaciones evolutivas.
Construir el árbol :Utilice el método seleccionado para construir el árbol evolutivo. El resultado suele ser un diagrama o cladograma que representa los patrones de ramificación y las relaciones evolutivas entre los organismos estudiados.
Análisis Bootstrap (opcional) :Realice un arranque para evaluar el soporte estadístico de los patrones de ramificación en el árbol. El análisis Bootstrap vuelve a muestrear repetidamente los datos para crear múltiples árboles, proporcionando valores de confianza estadística (es decir, valores bootstrap) para cada rama.
Enraizar el árbol :Identifica y especifica la raíz del árbol. Suele ser un nodo ancestral o un grupo externo que representa el ancestro común más reciente de todos los organismos del árbol.
Interpretar el árbol :Analizar los patrones de ramificación y las longitudes para inferir relaciones evolutivas, tiempos de divergencia y posibles ancestros comunes. Identificar clados (grupos de organismos que comparten un ancestro común) y la historia evolutiva de las especies estudiadas.
Refinar el árbol (opcional) :Si hay datos adicionales disponibles o se utilizan parámetros diferentes, el árbol se puede refinar o actualizar para mejorar su precisión y resolución.