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    Las simulaciones numéricas revelan cómo la función de las proteínas se ve afectada por su entorno naturalmente congestionado
    Las proteínas no existen aisladas dentro de las células, sino que residen en un entorno dinámico y muy poblado. Comprender cómo este entorno influye en la estructura y función de las proteínas es un desafío fundamental en biofísica. Aquí, utilizamos extensas simulaciones de dinámica molecular atomística y cálculos de energía libre para investigar cómo el ambiente naturalmente poblado dentro de una célula afecta la estructura, la dinámica interna y la función de una proteína prototípica, la RNasa H. Nuestras simulaciones demuestran que el ambiente lleno de gente compacta significativamente la estructura proteica, lo que lleva a una conformación proteica más ordenada y rígida. Esta compactación se manifiesta en un aumento de los parámetros del orden de la cadena principal y de las cadenas laterales y en una reducción de las fluctuaciones internas de las proteínas. Además, la dinámica reducida de la RNasa H dentro del ambiente abarrotado altera significativamente su paisaje conformacional, afectando las poblaciones y las diferencias de energía libre de diferentes subestados funcionales. Estos hallazgos proporcionan información atomística sobre la influencia del hacinamiento celular en la estructura y dinámica de las proteínas, lo que subraya la importancia de considerar el medio celular al estudiar la función de las proteínas.
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