Resumen:

Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) es un importante patógeno transmitido por los alimentos que puede causar gastroenteritis grave en humanos. El cerdo es un importante reservorio natural y una fuente esencial de infecciones por salmonelosis humana en todo el mundo. Comprender la base genética de la adaptación y colonización de S. Typhimurium dentro del cerdo es clave para desarrollar intervenciones efectivas para controlar la salmonella en los sistemas de producción porcina y reducir las infecciones humanas. En este estudio, realizamos la secuenciación del genoma completo de 200 aislados de S. Typhimurium obtenidos de diferentes fuentes a lo largo de la cadena de producción porcina, incluidas granjas, mataderos y productos porcinos. El análisis genómico comparativo reveló la presencia de distintas variantes genómicas asociadas con cada etapa de la cadena de producción, destacando la capacidad de las bacterias para adaptarse a las diferentes condiciones ambientales. Se descubrió que los aislados que albergan genes de virulencia específicos, como los implicados en la invasión intestinal y la propagación sistémica, eran más prevalentes en los cerdos que en otras fuentes, lo que indica la ventaja selectiva de estos genes para la supervivencia y la persistencia dentro del huésped. Además, identificamos islas genómicas exclusivas de aislamientos de S. Typhimurium de cerdos que podrían contribuir a su adaptación y colonización en esta especie huésped. Estos hallazgos proporcionan nuevos conocimientos sobre los mecanismos genéticos de la adaptación y persistencia del huésped de la salmonella e identifican objetivos potenciales para controlar la salmonella en la producción de carne de cerdo y reducir el riesgo de infección humana.