Hallazgos, ahora publicados en Plant, Cell &Environment , muestran que los microbiomas en la zona de la superficie de la raíz y la rizosfera son distintivos en cuatro especies de árboles diferentes. Los resultados también mostraron diferencias entre el rizoplano bacteriano y los compartimentos de la rizosfera para las raíces finas absorbentes, pero no para las raíces finas transportadoras.

Descifrar las relaciones huésped-microbiano requiere una comprensión compleja de la fisiología y morfología del huésped, en este caso, las raíces de las plantas. La clasificación de las raíces finas es importante para evaluar diversos procesos ecológicos, incluidos los ciclos biogeoquímicos a escala fina y las relaciones entre las raíces y los microbios.

Los resultados de este estudio muestran que varios compartimentos de la raíz están estructurados diferencialmente según el tipo funcional de la raíz y los recursos disponibles. Además, los hallazgos proporcionan evidencia de que la composición microbiana está estructurada espacialmente según el tipo funcional de la raíz y que existen presiones selectivas para cada compartimento de la raíz para diferentes tipos funcionales de la raíz.

Estos datos enfatizan la necesidad de examinar la fisiología de las raíces al examinar la retroalimentación microbiana de las raíces porque hay más información de la que se reconocía previamente dentro de los compartimentos de las raíces individuales u homogeneizadas.

Los grupos de microbiomas en las raíces de las plantas desempeñan funciones críticas e interactivas con la planta o el huésped. Pero en los estudios de microbioma, los investigadores rara vez se centran en las raíces finas (2 milímetros o menos) y sus diferentes funciones funcionales.

Utilizando un bosque jardín común de 26 años de antigüedad, un equipo multiinstitucional de investigadores recolectó finas muestras de raíces de cuatro especies de árboles de zonas templadas (tres de hoja caduca y una conífera) que variaban en su morfología.

A través de la secuenciación de genes, así como del análisis metabolómico en el Laboratorio de Ciencias Moleculares Ambientales, los investigadores observaron que las raíces finas compartimentan funciones, y dentro de estos compartimentos, las bacterias y los hongos funcionan de manera diferente. Es probable que esto se deba a si hay recursos nutricionales disponibles en cada compartimento y cómo.

Además, los investigadores observaron diferencias en los datos de los rizoplanos frente a las rizosferas. Las bacterias en los rizoplanos (la superficie de la raíz y las partículas del suelo que las rodean inmediatamente), así como el metaboloma de la raíz y las funciones microbianas potenciales, diferían entre las raíces finas absorbentes y transportadoras. Pero las bacterias de la rizosfera (el suelo biogeoquímico cercano a las raíces) no cambiaron.

Estos hallazgos muestran la importancia de la función de la raíz al examinar las relaciones entre la raíz y los microbios, enfatizando las diferentes presiones selectivas del huésped impartidas en diferentes compartimentos del microbioma de la raíz.