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    El primer atlas de micobiomas describe asociaciones entre cánceres y hongos

    Rob Knight, PhD, es profesor en los departamentos de Pediatría de la Facultad de Medicina de UC San Diego y de Bioingeniería y Ciencias de la Computación en la Facultad de Ingeniería Jacobs de UC San Diego. Crédito:Ciencias de la Salud de UC San Diego

    Un equipo internacional de científicos, codirigido por investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de California en San Diego, ha creado el primer atlas de micobiomas pancancerosos:una encuesta de 35 tipos de cáncer y sus hongos asociados.

    Los hallazgos se publican el 29 de septiembre de 2022 en la revista Cell .

    Las células cancerosas y los microbios tienen una asociación larga y duradera. Ambos han coevolucionado dentro de los ecosistemas del cuerpo humano, a menudo dependiendo de los mismos recursos. La competencia por estos recursos a menudo afecta la replicación y supervivencia de las células cancerosas, los microbios y el huésped humano.

    La asociación entre el cáncer y los microbios individuales se ha estudiado caso por caso durante mucho tiempo, pero gran parte de la atención reciente se centra en todo el microbioma humano, particularmente en el intestino, que alberga más comunidades de bacterias, virus y hongos, y más diversas, que en cualquier otro lugar. otra cosa en o sobre el cuerpo humano.

    Sin embargo, las funciones y la influencia de los hongos asociados con el cáncer siguen sin estudiarse en gran medida y se desconocen. Los hongos son organismos más complicados que los virus y las bacterias. Son eucariotas, organismos con células que contienen núcleos. Sus células son mucho más parecidas a las células animales que a las bacterias o los virus.

    "La existencia de hongos en la mayoría de los cánceres humanos es tanto una sorpresa como una expectativa", dijo Rob Knight, Ph.D., profesor de los departamentos de Pediatría de la Facultad de Medicina de UC San Diego y de Bioingeniería e Informática de UC San Diego. Jacobs School of Engineering, Wolfe Family Endowed Chair in Microbiome Research en Rady Children's Hospital-San Diego y cofundador de Micronoma, una empresa con sede en San Diego que desarrolla biomarcadores microbianos en sangre y tejidos para diagnosticar y tratar cánceres.

    "Es sorprendente porque no sabemos cómo los hongos pueden ingresar a los tumores en todo el cuerpo. Pero también se espera porque se ajusta al patrón de microbiomas saludables en todo el cuerpo, incluidos el intestino, la boca y la piel, donde interactúan las bacterias y los hongos. como parte de una comunidad compleja".

    Los hongos que se encuentran en el cuerpo humano son de dos tipos principales:hongos ambientales, como la levadura y el moho, que generalmente no representan ningún daño para la mayoría de las personas sanas, y los hongos comensales, que viven sobre o dentro del cuerpo humano y pueden ser inofensivos, pero brindan un beneficio. como mejorar la salud intestinal o contribuir a enfermedades, como infecciones por levaduras o enfermedades hepáticas. Los hongos también desempeñan un papel en la formación de la inmunidad del huésped, para bien o para mal, lo que cobra mucha importancia en las personas inmunodeprimidas, incluidos los pacientes con cáncer.

    El nuevo estudio caracteriza el micobioma del cáncer (hongos vinculados a los cánceres) en 17 401 muestras de tejidos, sangre y plasma de pacientes en 35 tipos de cáncer en cuatro cohortes independientes. Los investigadores encontraron ADN y células fúngicas en cantidades bajas en muchos de los principales cánceres humanos, con diferencias en las composiciones de la comunidad que diferían entre los tipos de cáncer.

    "The finding that fungi are commonly present in human tumors should drive us to better explore their potential effects and re-examine almost everything we know about cancer through a 'microbiome lens,'" said co-corresponding author Ravid Straussman, MD, Ph.D., a principal investigator at Weizmann Institute of Science.

    Analyses that compared fungal communities with matched bacteriomes (the bacterial component of the microbiome) and immunomes (genes and proteins constituting the immune system) revealed that the associations between them were often "permissive," rather than competitive.

    For example, one species of fungi was found to be enriched in breast cancer tumors of patients older than 50 years while another species was notably abundant in lung cancer samples.

    The researchers said there were significant correlations between specific fungi and age, tumor subtypes, smoking status, response to immunotherapy and survival measures. Whether the fungi are simply correlated or causally associated remains to be determined.

    "These findings validate the view that the microbiome in its entirety is a key piece of cancer biology," said study co-author Gregory Sepich-Poore, Ph.D., co-founder and chief analytics officer at Micronoma, "and may present significant translational opportunities, not only in cancer detection, but also in other biotech applications related to drug development, cancer evolution, minimal residual disease, relapse and companion diagnostics." + Explora más

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