Los investigadores de la Universidad Estatal de Iowa han creado una base de datos en línea accesible que trae datos genómicos críticos a un enfoque nítido con un solo clic del mouse.

En un artículo publicado hoy en la revista Informes científicos , un equipo de investigadores de la Universidad Estatal de Iowa presentó una base de datos novedosa que permite a los científicos acceder rápidamente a información sobre estructuras de ARN codificadas dentro del genoma humano. La base de datos es de libre acceso para cualquier persona en la web, donde permite a los científicos estudiar las funciones y la estructura del ARN con mayor rapidez y facilidad que en el pasado. Esto ayudará a facilitar la investigación básica en biología humana y podría allanar el camino para nuevos tratamientos médicos que se dirijan al ARN. dijo Walter Moss, profesor asistente en el Departamento de Bioquímica Roy J. Carver, Biofísica y Biología Molecular.

ARN, abreviatura de ácidos ribonucleicos, son cadenas moleculares que se transcriben, o copiado, del genoma. Los ARN pueden ser portadores de información, actuando como intermediarios entre el ADN y la proteína, o como moléculas de funcionamiento independiente que median muchos procesos reguladores críticos. A diferencia del ADN, El ARN puede "replegarse" sobre sí mismo para formar estructuras que rivalizan con las proteínas en su complejidad. Este plegamiento juega un papel clave en la función del ARN, por lo que obtener información estructural sobre el ARN puede proporcionar información importante sobre nuestra comprensión de cómo funcionan los organismos, Moss dijo.

"El ARN es fundamental para comprender la biología, y los avances en la tecnología de secuenciación han llevado a una explosión en la lista de ARN potencialmente funcionales, " él dijo.

Por ejemplo, mientras que solo alrededor del 2 por ciento de los 3500 millones de pares de bases del ADN humano codifican proteínas, más del 70 por ciento se transcribe en ARN. Comprender las funciones de este océano de ARN inexplorado plantea un desafío científico clave, y la nueva base de datos proporciona herramientas cruciales para trazarla, Moss dijo.

Musgo, junto con el estudiante graduado Ryan Andrews y el director de investigación de TI Levi Baber, fragmentó todo el genoma humano en más de 154 millones de ventanas superpuestas y calculó una serie de métricas valiosas para comprender cómo se pliega el ARN.

"Cualquier persona en todo el mundo puede ahora recuperar con un clic lo que antes requería horas de cálculos para determinar, "Dijo Andrews.

Terapéutica de ARN, un nuevo enfoque en medicina en el que el ARN se dirige con medicamentos en lugar de proteínas, muestra una gran promesa, y la base de datos estructural detallada en la publicación proporciona un gran depósito de potenciales pistas terapéuticas, Moss dijo.