Una nueva técnica ideada por investigadores de la Universidad Estatal de Carolina del Norte y la Universidad de Calgary proporciona una mirada más profunda a la composición y actividad dentro de las comunidades microbianas:la vida microscópica dentro de nuestros cuerpos y todo lo que nos rodea.

En lugar de depender de una encuesta sobre la cantidad de microbios presentes en una muestra determinada, la nueva técnica intenta evaluar la biomasa, la abundancia de proteínas, de esos microbios, que incluyen bacterias, virus y otras formas de vida diminutas. Las comunidades microbianas desempeñan un papel importante en la salud y las enfermedades animales y vegetales, así como en procesos ambientales importantes como la descomposición de materia orgánica y el ciclo de nutrientes en suelos y océanos. Los estudios sobre estas comunidades se han generalizado cada vez más en los últimos años.

Manuel Kleiner, un profesor asistente de NC State de biología vegetal y microbiana y autor correspondiente de un artículo que informa sobre la investigación, dice que las diferencias en la evaluación de comunidades microbianas se pueden comparar con las diferencias entre un censo de vecindario y un estudio más profundo de ese vecindario.

"La mayoría de los estudios de comunidades microbianas actuales son como un censo de qué tipos de microbios están presentes en una comunidad y cuántos, que proporciona buena información básica, ", Dijo Kleiner." Estamos buscando algo más profundo, por lo que nuestra técnica se puede comparar con entrevistar a los residentes del vecindario para averiguar más sobre quiénes son, qué hacen y cuánto contribuyen a su comunidad.

"En cuanto a las comunidades microbianas, Esta mirada más profunda significa examinar la biomasa de estos microbios, lo que nos da mejores pistas sobre la actividad e influencia microbianas. Hasta ahora, no hemos tenido una forma de cuantificar los miembros individuales de las comunidades microbianas en función de la masa ".

Para probar el nuevo método, los investigadores cultivaron varios organismos en el laboratorio y contaron sus células y sus proteínas, y luego los mezcló todos para crear una comunidad artificial.

"Creamos varias de estas comunidades artificiales con diferentes distribuciones microbianas para que pudiéramos probar y ver si obtuvimos resultados que reflejaran los microbios que introdujimos originalmente, "Dijo Kleiner.

Los resultados mostraron que los resultados del nuevo método reflejaban las comunidades microbianas reales de manera muy eficaz.

Próximo, los investigadores probaron el nuevo método en lagos de soda alcalina de las Montañas Rocosas, masas de agua viscosa con valores elevados de salinidad y pH. Ellos encontraron, en uno de los lagos, que el nuevo método fue capaz de identificar algas que no se encontraron con el método más común de "conteo".

Los investigadores también utilizaron el nuevo método para examinar un conjunto de datos existente de saliva de múltiples bocas humanas y encontraron mucha más variación en las comunidades microbianas de lo que mostraron estudios anteriores.

"El nuevo método da una dimensión completamente diferente a la estructura de las comunidades microbianas, ", Dijo Kleiner." No es necesariamente un método 'mejor', pero uno complementario que podría proporcionar una mejor comprensión de estas comunidades ".

Kleiner agregó que todos los datos del estudio están disponibles públicamente, para que otros investigadores puedan probar la nueva técnica por sí mismos.