* molécula: Este es el término más común y general. Se refiere a dos o más átomos unidos por enlaces químicos.

* Compuesto: Este término es específico para las moléculas que están compuestas por dos o más * diferentes * tipos de átomos.

Por ejemplo, el agua (H₂O) es tanto una molécula como un compuesto, mientras que el gas de oxígeno (O₂) es una molécula pero no un compuesto.