Lisis celular:el SDS, un detergente aniónico, altera la bicapa de fosfolípidos de las membranas celulares al interactuar con las colas hidrofóbicas de los fosfolípidos. Esta interacción conduce a la desintegración de la membrana, lo que hace que la célula se abra y libere su contenido.
Solubilización de componentes celulares:después de la lisis celular, el SDS ayuda a solubilizar y mantener la solubilidad de varios componentes celulares, incluidas proteínas y lípidos, desnaturalizándolos y evitando que se agreguen. Esto garantiza que el ADN siga siendo accesible y facilita los pasos posteriores del proceso de aislamiento.
Desnaturalización de proteínas:el SDS tiene la capacidad de desnaturalizar proteínas, lo cual es crucial para el aislamiento del ADN. Las proteínas se unen estrechamente al ADN y pueden dificultar su extracción. Al desnaturalizar las proteínas, el SDS interrumpe estas interacciones proteína-ADN, lo que permite una separación eficiente del ADN de otros componentes celulares.
Accesibilidad del ADN:la desnaturalización de las proteínas también expone las moléculas de ADN, haciéndolas más accesibles a las enzimas y reactivos utilizados en los pasos posteriores del protocolo de aislamiento del ADN.
Complejos de proteína SDS:SDS forma micelas, que son estructuras esféricas con un interior hidrofóbico y un exterior hidrofílico. Las proteínas desnaturalizadas se unen a las regiones hidrofóbicas de las micelas SDS, formando complejos que las mantienen en solución y evitan su interferencia con la purificación del ADN.
Precipitación de ácidos nucleicos:en algunos métodos de aislamiento de ADN, como el método CTAB (bromuro de cetiltrimetilamonio), se puede utilizar SDS para mejorar la precipitación de ácidos nucleicos. Forma complejos con CTAB, que a su vez se une al esqueleto del ADN cargado negativamente, promoviendo la formación de precipitados densos de ácido nucleico y detergente que pueden sedimentarse fácilmente mediante centrifugación.
Es importante tener en cuenta que el SDS puede inhibir la actividad de algunas enzimas, como las enzimas de restricción, por lo que su concentración y la duración de la exposición al ADN deben controlarse cuidadosamente durante el procedimiento de aislamiento del ADN para evitar su degradación.